FASTQ

Формат FASTQ — текстовый формат данных, используемый для представления биологической последовательности (обычно нуклеотидной последовательности) и показателей качества каждого элемента последовательности. Элементы последовательности и их показатели качества кодируются для краткости одиночными символами ASCII. Применяется в биоинформатике.

Первоначально формат был разработан в Wellcome Trust Sanger Institute для объединения отформатированной последовательности FASTA и данных о качестве элементов, но затем он стал стандартом де-факто для хранения результатов высокоэффективных инструментов секвенирования, в частности для анализаторов генома корпорации Illumina.

Формат FASTQ не стандартизирован и различные аппаратно-программные системы обработки информации, использующие его для входных/выходных данных, могут иметь некоторые различия (например, разные системы кодирования показателя качества элементов последовательности).

Документ FASTQ обычно использует четыре строки на каждую последовательность.